广西木论国家级自然保护区与贵州茂兰国家级保护区相连,共同成为世界同纬度地区连片面积最大、保存最完好的喀斯特森林生态系统,是研究喀斯特及其森林的重要地域,具有重要的科研和保护价值。
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木论国家级自然保护区主要保护对象是保护具有全球意义的中亚热带喀斯特森林生态系统,保护区内地貌独特,植物资源丰富,还有汉代古道、古宾河等景观。